Fe y Alegría nace en África en el año 2007 en el Chad con una red rural de escuelas en la región del Guera cuya población es mayoritariamente musulmana; nace con el apoyo de las autoridades educativas del Estado chadiano. Este espíritu fundacional se extendió más tarde a Madagascar en el 2013, y al año siguiente a la República Democrática del Congo.
El primer Congreso Internacional de Fe y Alegría África, celebrado en enero 2016 en N’djamena, fue una oportunidad para dar a conocer la misión y visión del Movimiento a la gran familia jesuita del continente africano, y entusiasmar a otros países como ha sido el caso de Guinea-Conakry, Zimbabue, Mozambique y Kenia.